在电厂循环冷却水中往往有许多杂质，其中有有机质的，也有无机质的。有机物可使微生物生长，形成有机附着物，有机微生物大量繁殖给冷却水系统带来许多危害，使系统传热效率降低，诱导金属腐蚀，严重时还可能对管路造成堵塞。无机物可使凝结器铜管结垢，导致凝结水温度升高，从而使凝结器的真空度下降，影响机组的安全经济运行。通常，循环冷却水中所遇到的腐蚀、结垢、生物污垢等几个问题，采用水处理技术是能够解决的。所谓冷却水处理技术是指对循环冷却水系统的水质、设备材质、工况条件选择缓蚀剂、阻垢剂、分散剂、杀菌剂正确匹配组成水处理配方，提出工艺控制条件，提供相应清洗、顶膜方案等。
杀菌剂的种类目前国内使用最多、技术较成熟的杀菌灭藻技术为化学杀菌技术。这类技术是利用化学药剂对细菌进行杀除，即使用杀菌剂。对于这类药剂的一般要求为：低（无）毒、无腐蚀，同时具有缓蚀、阻垢作用或能与缓蚀剂、阻垢剂配合使用，成本低、生产及运输安全，投药方便。化学杀菌剂一般分为氧化性和非氧化性两大类。
氧化性杀菌剂应用较早，在冷却水中已用了半个多世纪了，人们对它的了解越来越深入了。这类杀菌剂通常是一些强氧化剂，如卤素中的氯、溴和碘，还有氯的化合物、臭氧等。大体可分为五大类氯基杀菌剂、溴基杀菌剂、二氧化氯、过氧化物和臭氧。
非氧化性杀菌剂是冷却水处理中另一大类杀菌剂，它的种类很多，其杀菌效果有的比氧化性杀菌剂要好。
在循环水处理中氧化性杀菌剂和非氧化性杀菌剂必须交替使用，以防止循环水中微生物对其产生抗药性。非氧化性杀菌剂主要有氯酚、戊二醛、季胺盐、季磷盐、异噻唑啉酮等。
